MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cryptobacterium curtum DSM 15641 chromosome

Total Repeats: 32624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013170	CTG	2	6	30	35	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013170	CTT	2	6	82	87	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013170	TACAC	2	10	90	99	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4	NC_013170	CAG	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826461
5	NC_013170	GTT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826461
6	NC_013170	AGAT	2	8	209	216	50 %	25 %	25 %	0 %	256826461
7	NC_013170	TCA	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826461
8	NC_013170	A	6	6	292	297	100 %	0 %	0 %	0 %	256826461
9	NC_013170	TTA	2	6	323	328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256826461
10	NC_013170	GAA	2	6	340	345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826461
11	NC_013170	CTG	2	6	395	400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826461
12	NC_013170	CAG	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826461
13	NC_013170	CAA	2	6	421	426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826461
14	NC_013170	CACAC	2	10	439	448	40 %	0 %	0 %	60 %	256826461
15	NC_013170	AC	3	6	453	458	50 %	0 %	0 %	50 %	256826461
16	NC_013170	TAA	2	6	531	536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256826461
17	NC_013170	CTG	2	6	563	568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826461
18	NC_013170	TTTA	2	8	721	728	25 %	75 %	0 %	0 %	256826461
19	NC_013170	TGC	2	6	852	857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826461
20	NC_013170	CAAA	2	8	891	898	75 %	0 %	0 %	25 %	256826461
21	NC_013170	TGA	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826461
22	NC_013170	AAGA	2	8	952	959	75 %	0 %	25 %	0 %	256826461
23	NC_013170	GTT	2	6	1015	1020	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826461
24	NC_013170	T	6	6	1019	1024	0 %	100 %	0 %	0 %	256826461
25	NC_013170	A	6	6	1041	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	256826461
26	NC_013170	ACC	2	6	1107	1112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256826461
27	NC_013170	TAT	2	6	1134	1139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256826461
28	NC_013170	GAA	2	6	1153	1158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826461
29	NC_013170	CGA	2	6	1162	1167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826461
30	NC_013170	ACG	2	6	1175	1180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826461
31	NC_013170	AGT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826461
32	NC_013170	TAA	2	6	1284	1289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256826461
33	NC_013170	GCT	2	6	1318	1323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826461
34	NC_013170	CTG	2	6	1327	1332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826461
35	NC_013170	GTCA	2	8	1411	1418	25 %	25 %	25 %	25 %	256826461
36	NC_013170	TGG	2	6	1427	1432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826461
37	NC_013170	AT	3	6	1477	1482	50 %	50 %	0 %	0 %	256826461
38	NC_013170	GAT	2	6	1494	1499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826461
39	NC_013170	ATTC	2	8	1559	1566	25 %	50 %	0 %	25 %	256826461
40	NC_013170	GAA	2	6	1576	1581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826461
41	NC_013170	GCC	2	6	1595	1600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256826461
42	NC_013170	GT	3	6	1665	1670	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013170	ATA	2	6	1717	1722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_013170	TTA	3	9	1729	1737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_013170	TTA	2	6	1766	1771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_013170	CCA	2	6	1814	1819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_013170	TTA	2	6	1831	1836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_013170	TAT	3	9	1838	1846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_013170	TA	4	8	1852	1859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013170	TCAACA	2	12	1879	1890	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	256826462
51	NC_013170	TTG	2	6	1918	1923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826462
52	NC_013170	GCA	2	6	1932	1937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826462
53	NC_013170	TC	3	6	2021	2026	0 %	50 %	0 %	50 %	256826462
54	NC_013170	GAA	3	9	2055	2063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826462
55	NC_013170	TTAC	2	8	2088	2095	25 %	50 %	0 %	25 %	256826462
56	NC_013170	AGC	2	6	2120	2125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826462
57	NC_013170	AAC	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826462
58	NC_013170	GGT	2	6	2297	2302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826462
59	NC_013170	TGA	2	6	2309	2314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826462
60	NC_013170	TGC	2	6	2338	2343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826462
61	NC_013170	ATG	2	6	2353	2358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826462
62	NC_013170	TGG	2	6	2371	2376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826462
63	NC_013170	ACT	2	6	2418	2423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826462
64	NC_013170	TTG	2	6	2530	2535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826462
65	NC_013170	GAC	2	6	2549	2554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826462
66	NC_013170	CGG	2	6	2565	2570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256826462
67	NC_013170	GAA	2	6	2808	2813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826462
68	NC_013170	TTA	2	6	2944	2949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256826462
69	NC_013170	CGGTT	2	10	2953	2962	0 %	40 %	40 %	20 %	256826462
70	NC_013170	CTT	2	6	2981	2986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256826463
71	NC_013170	AGA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826463
72	NC_013170	ACC	2	6	3044	3049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256826463
73	NC_013170	GTG	2	6	3121	3126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826463
74	NC_013170	CAA	2	6	3221	3226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826463
75	NC_013170	ATC	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826463
76	NC_013170	GAA	2	6	3268	3273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826463
77	NC_013170	TCG	2	6	3306	3311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826463
78	NC_013170	CG	4	8	3310	3317	0 %	0 %	50 %	50 %	256826463
79	NC_013170	CTG	2	6	3338	3343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826463
80	NC_013170	CTT	2	6	3383	3388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256826463
81	NC_013170	A	6	6	3432	3437	100 %	0 %	0 %	0 %	256826463
82	NC_013170	A	7	7	3479	3485	100 %	0 %	0 %	0 %	256826463
83	NC_013170	TGA	2	6	3531	3536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
84	NC_013170	TAG	2	6	3548	3553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
85	NC_013170	TTCT	2	8	3563	3570	0 %	75 %	0 %	25 %	256826463
86	NC_013170	TGA	2	6	3581	3586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
87	NC_013170	AT	3	6	3660	3665	50 %	50 %	0 %	0 %	256826463
88	NC_013170	GAA	2	6	3679	3684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826463
89	NC_013170	AGCA	2	8	3746	3753	50 %	0 %	25 %	25 %	256826463
90	NC_013170	GTT	2	6	3784	3789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826463
91	NC_013170	ATG	2	6	3830	3835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
92	NC_013170	CAG	2	6	3859	3864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826463
93	NC_013170	TGA	2	6	3945	3950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
94	NC_013170	TGA	2	6	3953	3958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
95	NC_013170	ATC	2	6	3968	3973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826463
96	NC_013170	GAT	2	6	3996	4001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
97	NC_013170	ACA	2	6	4030	4035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826463
98	NC_013170	TGA	2	6	4053	4058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826463
99	NC_013170	GGC	2	6	4116	4121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256826464
100	NC_013170	AAC	2	6	4224	4229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826464
101	NC_013170	ACGA	2	8	4265	4272	50 %	0 %	25 %	25 %	256826464
102	NC_013170	CGT	2	6	4277	4282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826464
103	NC_013170	TGA	2	6	4300	4305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826464
104	NC_013170	TGC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826464
105	NC_013170	TAA	2	6	4327	4332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256826464
106	NC_013170	TTA	2	6	4344	4349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256826464
107	NC_013170	CGA	2	6	4384	4389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826464
108	NC_013170	GAAA	2	8	4419	4426	75 %	0 %	25 %	0 %	256826464
109	NC_013170	A	6	6	4452	4457	100 %	0 %	0 %	0 %	256826464
110	NC_013170	AC	5	10	4463	4472	50 %	0 %	0 %	50 %	256826464
111	NC_013170	CAA	2	6	4481	4486	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826464
112	NC_013170	CAA	2	6	4514	4519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826464
113	NC_013170	A	6	6	4518	4523	100 %	0 %	0 %	0 %	256826464
114	NC_013170	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826464
115	NC_013170	CGA	2	6	4582	4587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826464
116	NC_013170	GAT	2	6	4615	4620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826464
117	NC_013170	AAG	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826464
118	NC_013170	A	6	6	4656	4661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013170	CTAA	2	8	4664	4671	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_013170	TTA	2	6	4767	4772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_013170	ACG	2	6	4841	4846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
122	NC_013170	GTAT	2	8	4898	4905	25 %	50 %	25 %	0 %	256826465
123	NC_013170	CCA	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256826465
124	NC_013170	TCA	2	6	4932	4937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826465
125	NC_013170	CGA	2	6	4968	4973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
126	NC_013170	CGA	2	6	5016	5021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
127	NC_013170	GTA	2	6	5024	5029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826465
128	NC_013170	GTT	2	6	5101	5106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826465
129	NC_013170	TGG	2	6	5124	5129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826465
130	NC_013170	TGG	2	6	5136	5141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826465
131	NC_013170	GGT	2	6	5161	5166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826465
132	NC_013170	GTT	2	6	5188	5193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826465
133	NC_013170	TGT	2	6	5289	5294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826465
134	NC_013170	GAC	2	6	5358	5363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
135	NC_013170	ACA	2	6	5375	5380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826465
136	NC_013170	CCTT	2	8	5408	5415	0 %	50 %	0 %	50 %	256826465
137	NC_013170	GA	4	8	5446	5453	50 %	0 %	50 %	0 %	256826465
138	NC_013170	ATTT	2	8	5563	5570	25 %	75 %	0 %	0 %	256826465
139	NC_013170	GTTC	2	8	5621	5628	0 %	50 %	25 %	25 %	256826465
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143	NC_013170	GAC	2	6	5782	5787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
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146	NC_013170	AGTT	2	8	5885	5892	25 %	50 %	25 %	0 %	256826465
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151	NC_013170	AGC	2	6	5994	5999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826465
152	NC_013170	GTA	3	9	6074	6082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826465
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155	NC_013170	TTA	2	6	6254	6259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256826465
156	NC_013170	CAT	2	6	6318	6323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826465
157	NC_013170	CTGATG	2	12	6332	6343	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	256826465
158	NC_013170	TGT	2	6	6368	6373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826465
159	NC_013170	AT	3	6	6417	6422	50 %	50 %	0 %	0 %	256826465
160	NC_013170	GCC	2	6	6435	6440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256826465
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163	NC_013170	ATT	2	6	6760	6765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_013170	AAC	2	6	6836	6841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826466
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266	NC_013170	GAA	2	6	11176	11181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826468
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288	NC_013170	ATT	2	6	12442	12447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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401	NC_013170	GCA	2	6	19271	19276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
402	NC_013170	AGG	2	6	19318	19323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
403	NC_013170	TCAA	2	8	19401	19408	50 %	25 %	0 %	25 %	256826471
404	NC_013170	GAC	2	6	19434	19439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826471
405	NC_013170	TCC	2	6	19454	19459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256826471
406	NC_013170	CA	3	6	19473	19478	50 %	0 %	0 %	50 %	256826471
407	NC_013170	TGT	2	6	19481	19486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826471
408	NC_013170	GATC	2	8	19538	19545	25 %	25 %	25 %	25 %	256826471
409	NC_013170	GCGA	2	8	19569	19576	25 %	0 %	50 %	25 %	256826471
410	NC_013170	TGT	2	6	19595	19600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826471
411	NC_013170	CAA	2	6	19753	19758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826471
412	NC_013170	GT	3	6	19804	19809	0 %	50 %	50 %	0 %	256826471
413	NC_013170	GGAA	2	8	19863	19870	50 %	0 %	50 %	0 %	256826471
414	NC_013170	ACC	2	6	19938	19943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256826471
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416	NC_013170	ACT	2	6	20032	20037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256826471
417	NC_013170	TTG	3	9	20062	20070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826471
418	NC_013170	GGAAT	2	10	20099	20108	40 %	20 %	40 %	0 %	256826471
419	NC_013170	TGT	2	6	20141	20146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826471
420	NC_013170	CG	3	6	20155	20160	0 %	0 %	50 %	50 %	256826471
421	NC_013170	GAT	2	6	20184	20189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826471
422	NC_013170	TGG	2	6	20213	20218	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826471
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424	NC_013170	ACT	2	6	20399	20404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
425	NC_013170	GCT	2	6	20432	20437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
426	NC_013170	GTT	2	6	20537	20542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826472
427	NC_013170	AAGCG	2	10	20550	20559	40 %	0 %	40 %	20 %	256826472
428	NC_013170	TGA	2	6	20614	20619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826472
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430	NC_013170	AGC	2	6	20743	20748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826472
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432	NC_013170	TGGG	2	8	20833	20840	0 %	25 %	75 %	0 %	256826472
433	NC_013170	TCC	2	6	20949	20954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256826472
434	NC_013170	TGC	2	6	20956	20961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256826472
435	NC_013170	GT	3	6	20967	20972	0 %	50 %	50 %	0 %	256826472
436	NC_013170	TCGA	2	8	21029	21036	25 %	25 %	25 %	25 %	256826472
437	NC_013170	GAC	2	6	21050	21055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256826472
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442	NC_013170	ACA	2	6	21488	21493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826472
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444	NC_013170	TCT	2	6	21559	21564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256826472
445	NC_013170	GGC	2	6	21612	21617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256826472
446	NC_013170	TGT	2	6	21633	21638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826472
447	NC_013170	CGC	2	6	21755	21760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256826472
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451	NC_013170	CAA	2	6	21942	21947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256826472
452	NC_013170	AGA	2	6	21985	21990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826472
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475	NC_013170	AAG	2	6	22957	22962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_013170	TCG	2	6	22965	22970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_013170	CAATA	2	10	23035	23044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
478	NC_013170	A	6	6	23072	23077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
479	NC_013170	CTG	2	6	23086	23091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
480	NC_013170	GC	3	6	23096	23101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
481	NC_013170	ACA	2	6	23221	23226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
482	NC_013170	TCCC	2	8	23271	23278	0 %	25 %	0 %	75 %	256826474
483	NC_013170	ATG	2	6	23282	23287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826474
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489	NC_013170	GAA	2	6	23497	23502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256826474
490	NC_013170	ATG	2	6	23537	23542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256826474
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497	NC_013170	A	7	7	23741	23747	100 %	0 %	0 %	0 %	256826474
498	NC_013170	TGG	2	6	23753	23758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256826474
499	NC_013170	TTG	2	6	23933	23938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256826474
500	NC_013170	ATGG	2	8	24038	24045	25 %	25 %	50 %	0 %	256826474

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